Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vmn1r58G3X9U3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r58G3X9U3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r58G3X9U3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms