Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hmgxb3G3X9M3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hmgxb3G3X9M3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hmgxb3G3X9M3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms