Protein–RNA interactions for Protein: G3UW56

Vmn2r85, MCG21565, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r85G3UW56 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r85G3UW56 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r85G3UW56 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r85G3UW56 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r85G3UW56 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r85G3UW56 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r85G3UW56 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r85G3UW56 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r85G3UW56 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r85G3UW56 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r85G3UW56 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r85G3UW56 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r85G3UW56 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r85G3UW56 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r85G3UW56 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r85G3UW56 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r85G3UW56 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r85G3UW56 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r85G3UW56 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r85G3UW56 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r85G3UW56 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r85G3UW56 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r85G3UW56 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r85G3UW56 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Vmn2r85G3UW56 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r85G3UW56 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r85G3UW56 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r85G3UW56 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r85G3UW56 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r85G3UW56 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r85G3UW56 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r85G3UW56 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r85G3UW56 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r85G3UW56 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r85G3UW56 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r85G3UW56 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r85G3UW56 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r85G3UW56 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r85G3UW56 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r85G3UW56 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r85G3UW56 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r85G3UW56 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r85G3UW56 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r85G3UW56 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn2r85G3UW56 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn2r85G3UW56 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn2r85G3UW56 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn2r85G3UW56 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn2r85G3UW56 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms