Protein–RNA interactions for Protein: F8VQK7

Gm16519, Predicted gene, 16519, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16519F8VQK7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm16519F8VQK7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm16519F8VQK7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm16519F8VQK7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm16519F8VQK7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm16519F8VQK7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm16519F8VQK7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm16519F8VQK7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm16519F8VQK7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm16519F8VQK7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm16519F8VQK7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm16519F8VQK7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm16519F8VQK7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm16519F8VQK7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm16519F8VQK7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm16519F8VQK7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm16519F8VQK7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm16519F8VQK7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm16519F8VQK7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm16519F8VQK7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm16519F8VQK7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm16519F8VQK7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm16519F8VQK7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm16519F8VQK7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm16519F8VQK7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm16519F8VQK7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm16519F8VQK7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm16519F8VQK7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm16519F8VQK7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm16519F8VQK7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm16519F8VQK7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm16519F8VQK7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm16519F8VQK7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm16519F8VQK7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm16519F8VQK7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm16519F8VQK7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm16519F8VQK7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm16519F8VQK7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm16519F8VQK7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm16519F8VQK7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm16519F8VQK7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm16519F8VQK7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm16519F8VQK7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm16519F8VQK7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm16519F8VQK7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm16519F8VQK7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm16519F8VQK7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm16519F8VQK7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm16519F8VQK7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm16519F8VQK7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm16519F8VQK7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm16519F8VQK7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm16519F8VQK7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm16519F8VQK7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms