Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ScaperF8VQ70 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ScaperF8VQ70 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ScaperF8VQ70 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ScaperF8VQ70 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ScaperF8VQ70 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ScaperF8VQ70 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ScaperF8VQ70 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ScaperF8VQ70 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ScaperF8VQ70 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ScaperF8VQ70 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ScaperF8VQ70 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ScaperF8VQ70 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ScaperF8VQ70 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ScaperF8VQ70 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ScaperF8VQ70 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ScaperF8VQ70 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ScaperF8VQ70 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ScaperF8VQ70 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ScaperF8VQ70 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms