Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Crocc2F6XLV1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Crocc2F6XLV1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Crocc2F6XLV1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Crocc2F6XLV1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Crocc2F6XLV1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Crocc2F6XLV1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Crocc2F6XLV1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Crocc2F6XLV1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Crocc2F6XLV1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Crocc2F6XLV1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Crocc2F6XLV1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Crocc2F6XLV1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Crocc2F6XLV1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Crocc2F6XLV1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Crocc2F6XLV1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Crocc2F6XLV1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Crocc2F6XLV1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Crocc2F6XLV1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Crocc2F6XLV1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Crocc2F6XLV1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Crocc2F6XLV1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Crocc2F6XLV1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Crocc2F6XLV1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Crocc2F6XLV1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
Crocc2F6XLV1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Crocc2F6XLV1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Crocc2F6XLV1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Crocc2F6XLV1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Crocc2F6XLV1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Crocc2F6XLV1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Crocc2F6XLV1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Crocc2F6XLV1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Crocc2F6XLV1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Crocc2F6XLV1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Crocc2F6XLV1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Crocc2F6XLV1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Crocc2F6XLV1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Crocc2F6XLV1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Crocc2F6XLV1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Crocc2F6XLV1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Crocc2F6XLV1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Crocc2F6XLV1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Crocc2F6XLV1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Crocc2F6XLV1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Crocc2F6XLV1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Crocc2F6XLV1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Crocc2F6XLV1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Crocc2F6XLV1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Crocc2F6XLV1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Crocc2F6XLV1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Crocc2F6XLV1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Crocc2F6XLV1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Crocc2F6XLV1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Crocc2F6XLV1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Crocc2F6XLV1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Crocc2F6XLV1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Crocc2F6XLV1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Crocc2F6XLV1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Crocc2F6XLV1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Crocc2F6XLV1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Crocc2F6XLV1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Crocc2F6XLV1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Crocc2F6XLV1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Crocc2F6XLV1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Crocc2F6XLV1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Crocc2F6XLV1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Crocc2F6XLV1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Crocc2F6XLV1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Crocc2F6XLV1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Crocc2F6XLV1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Crocc2F6XLV1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Crocc2F6XLV1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Crocc2F6XLV1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
Crocc2F6XLV1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Crocc2F6XLV1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Crocc2F6XLV1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Crocc2F6XLV1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Crocc2F6XLV1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Crocc2F6XLV1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Crocc2F6XLV1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Crocc2F6XLV1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Crocc2F6XLV1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Crocc2F6XLV1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Crocc2F6XLV1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Crocc2F6XLV1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Crocc2F6XLV1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Crocc2F6XLV1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Crocc2F6XLV1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Crocc2F6XLV1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Crocc2F6XLV1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Crocc2F6XLV1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Crocc2F6XLV1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Crocc2F6XLV1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Crocc2F6XLV1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Crocc2F6XLV1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Crocc2F6XLV1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Crocc2F6XLV1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Crocc2F6XLV1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Crocc2F6XLV1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms