Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3072F6SKY8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3072F6SKY8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3072F6SKY8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms