Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC067074F6RXI4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC067074F6RXI4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC067074F6RXI4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC067074F6RXI4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC067074F6RXI4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC067074F6RXI4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC067074F6RXI4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC067074F6RXI4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC067074F6RXI4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC067074F6RXI4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BC067074F6RXI4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BC067074F6RXI4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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BC067074F6RXI4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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BC067074F6RXI4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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BC067074F6RXI4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BC067074F6RXI4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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BC067074F6RXI4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BC067074F6RXI4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BC067074F6RXI4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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BC067074F6RXI4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BC067074F6RXI4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BC067074F6RXI4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BC067074F6RXI4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC067074F6RXI4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC067074F6RXI4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC067074F6RXI4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC067074F6RXI4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC067074F6RXI4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC067074F6RXI4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC067074F6RXI4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC067074F6RXI4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC067074F6RXI4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC067074F6RXI4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC067074F6RXI4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC067074F6RXI4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC067074F6RXI4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC067074F6RXI4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC067074F6RXI4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC067074F6RXI4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC067074F6RXI4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC067074F6RXI4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC067074F6RXI4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC067074F6RXI4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC067074F6RXI4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC067074F6RXI4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC067074F6RXI4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC067074F6RXI4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BC067074F6RXI4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BC067074F6RXI4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BC067074F6RXI4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BC067074F6RXI4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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