Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Herc6F2Z461 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Herc6F2Z461 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Herc6F2Z461 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Herc6F2Z461 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Herc6F2Z461 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Herc6F2Z461 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Herc6F2Z461 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Herc6F2Z461 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Herc6F2Z461 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Herc6F2Z461 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Herc6F2Z461 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Herc6F2Z461 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Herc6F2Z461 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Herc6F2Z461 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Herc6F2Z461 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Herc6F2Z461 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Herc6F2Z461 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Herc6F2Z461 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Herc6F2Z461 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Herc6F2Z461 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Herc6F2Z461 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Herc6F2Z461 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Herc6F2Z461 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Herc6F2Z461 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Herc6F2Z461 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms