Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3hdm1E9Q9Q2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3hdm1E9Q9Q2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3hdm1E9Q9Q2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3hdm1E9Q9Q2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
R3hdm1E9Q9Q2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
R3hdm1E9Q9Q2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
R3hdm1E9Q9Q2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3hdm1E9Q9Q2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
R3hdm1E9Q9Q2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3hdm1E9Q9Q2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
R3hdm1E9Q9Q2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3hdm1E9Q9Q2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3hdm1E9Q9Q2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
R3hdm1E9Q9Q2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
R3hdm1E9Q9Q2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
R3hdm1E9Q9Q2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
R3hdm1E9Q9Q2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
R3hdm1E9Q9Q2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
R3hdm1E9Q9Q2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
R3hdm1E9Q9Q2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms