Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Simc1E9Q6E9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Simc1E9Q6E9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Simc1E9Q6E9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Simc1E9Q6E9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Simc1E9Q6E9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Simc1E9Q6E9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Simc1E9Q6E9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Simc1E9Q6E9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Simc1E9Q6E9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Simc1E9Q6E9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Simc1E9Q6E9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Simc1E9Q6E9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Simc1E9Q6E9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Simc1E9Q6E9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Simc1E9Q6E9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Simc1E9Q6E9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Simc1E9Q6E9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Simc1E9Q6E9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Simc1E9Q6E9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Simc1E9Q6E9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Simc1E9Q6E9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Simc1E9Q6E9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Simc1E9Q6E9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Simc1E9Q6E9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Simc1E9Q6E9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Simc1E9Q6E9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Simc1E9Q6E9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Simc1E9Q6E9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Simc1E9Q6E9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Simc1E9Q6E9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Simc1E9Q6E9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Simc1E9Q6E9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Simc1E9Q6E9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Simc1E9Q6E9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Simc1E9Q6E9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Simc1E9Q6E9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Simc1E9Q6E9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Simc1E9Q6E9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Simc1E9Q6E9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Simc1E9Q6E9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Simc1E9Q6E9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Simc1E9Q6E9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Simc1E9Q6E9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Simc1E9Q6E9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Simc1E9Q6E9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Simc1E9Q6E9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Simc1E9Q6E9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Simc1E9Q6E9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Simc1E9Q6E9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Simc1E9Q6E9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Simc1E9Q6E9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Simc1E9Q6E9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Simc1E9Q6E9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Simc1E9Q6E9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Simc1E9Q6E9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Simc1E9Q6E9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Simc1E9Q6E9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Simc1E9Q6E9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Simc1E9Q6E9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Simc1E9Q6E9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Simc1E9Q6E9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Simc1E9Q6E9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Simc1E9Q6E9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Simc1E9Q6E9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Simc1E9Q6E9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Simc1E9Q6E9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Simc1E9Q6E9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Simc1E9Q6E9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Simc1E9Q6E9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Simc1E9Q6E9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Simc1E9Q6E9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Simc1E9Q6E9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Simc1E9Q6E9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Simc1E9Q6E9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Simc1E9Q6E9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Simc1E9Q6E9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Simc1E9Q6E9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Simc1E9Q6E9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Simc1E9Q6E9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Simc1E9Q6E9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Simc1E9Q6E9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Simc1E9Q6E9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Simc1E9Q6E9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Simc1E9Q6E9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Simc1E9Q6E9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Simc1E9Q6E9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Simc1E9Q6E9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Simc1E9Q6E9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Simc1E9Q6E9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Simc1E9Q6E9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Simc1E9Q6E9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Simc1E9Q6E9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Simc1E9Q6E9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Simc1E9Q6E9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Simc1E9Q6E9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Simc1E9Q6E9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Simc1E9Q6E9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Simc1E9Q6E9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Simc1E9Q6E9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms