Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ythdc1E9Q5K9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ythdc1E9Q5K9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ythdc1E9Q5K9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ythdc1E9Q5K9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ythdc1E9Q5K9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ythdc1E9Q5K9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ythdc1E9Q5K9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ythdc1E9Q5K9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ythdc1E9Q5K9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ythdc1E9Q5K9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ythdc1E9Q5K9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ythdc1E9Q5K9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ythdc1E9Q5K9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ythdc1E9Q5K9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ythdc1E9Q5K9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ythdc1E9Q5K9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ythdc1E9Q5K9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ythdc1E9Q5K9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ythdc1E9Q5K9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ythdc1E9Q5K9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ythdc1E9Q5K9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ythdc1E9Q5K9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ythdc1E9Q5K9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ythdc1E9Q5K9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ythdc1E9Q5K9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms