Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5G2

Pcdhb9, Protocadherin beta 9, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb9E9Q5G2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcdhb9E9Q5G2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcdhb9E9Q5G2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcdhb9E9Q5G2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcdhb9E9Q5G2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcdhb9E9Q5G2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcdhb9E9Q5G2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcdhb9E9Q5G2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcdhb9E9Q5G2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcdhb9E9Q5G2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcdhb9E9Q5G2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcdhb9E9Q5G2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcdhb9E9Q5G2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcdhb9E9Q5G2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcdhb9E9Q5G2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcdhb9E9Q5G2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcdhb9E9Q5G2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcdhb9E9Q5G2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcdhb9E9Q5G2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcdhb9E9Q5G2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcdhb9E9Q5G2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcdhb9E9Q5G2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcdhb9E9Q5G2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcdhb9E9Q5G2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcdhb9E9Q5G2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcdhb9E9Q5G2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms