Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
BC005561E9Q5E2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
BC005561E9Q5E2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
BC005561E9Q5E2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
BC005561E9Q5E2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
BC005561E9Q5E2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
BC005561E9Q5E2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
BC005561E9Q5E2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
BC005561E9Q5E2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
BC005561E9Q5E2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
BC005561E9Q5E2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
BC005561E9Q5E2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
BC005561E9Q5E2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
BC005561E9Q5E2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
BC005561E9Q5E2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
BC005561E9Q5E2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
BC005561E9Q5E2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
BC005561E9Q5E2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
BC005561E9Q5E2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
BC005561E9Q5E2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
BC005561E9Q5E2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
BC005561E9Q5E2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
BC005561E9Q5E2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
BC005561E9Q5E2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
BC005561E9Q5E2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
BC005561E9Q5E2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
BC005561E9Q5E2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
BC005561E9Q5E2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
BC005561E9Q5E2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
BC005561E9Q5E2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
BC005561E9Q5E2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
BC005561E9Q5E2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
BC005561E9Q5E2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
BC005561E9Q5E2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
BC005561E9Q5E2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
BC005561E9Q5E2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BC005561E9Q5E2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BC005561E9Q5E2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
BC005561E9Q5E2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
BC005561E9Q5E2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
BC005561E9Q5E2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
BC005561E9Q5E2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
BC005561E9Q5E2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
BC005561E9Q5E2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
BC005561E9Q5E2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
BC005561E9Q5E2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
BC005561E9Q5E2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
BC005561E9Q5E2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
BC005561E9Q5E2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
BC005561E9Q5E2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
BC005561E9Q5E2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
BC005561E9Q5E2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
BC005561E9Q5E2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
BC005561E9Q5E2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
BC005561E9Q5E2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
BC005561E9Q5E2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
BC005561E9Q5E2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
BC005561E9Q5E2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
BC005561E9Q5E2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
BC005561E9Q5E2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
BC005561E9Q5E2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
BC005561E9Q5E2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
BC005561E9Q5E2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
BC005561E9Q5E2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
BC005561E9Q5E2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
BC005561E9Q5E2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
BC005561E9Q5E2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
BC005561E9Q5E2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
BC005561E9Q5E2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
BC005561E9Q5E2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
BC005561E9Q5E2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
BC005561E9Q5E2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
BC005561E9Q5E2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
BC005561E9Q5E2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC33.8■■■■□ 3
BC005561E9Q5E2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
BC005561E9Q5E2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
BC005561E9Q5E2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
BC005561E9Q5E2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
BC005561E9Q5E2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
BC005561E9Q5E2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
BC005561E9Q5E2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
BC005561E9Q5E2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
BC005561E9Q5E2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
BC005561E9Q5E2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
BC005561E9Q5E2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
BC005561E9Q5E2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
BC005561E9Q5E2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BC005561E9Q5E2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BC005561E9Q5E2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BC005561E9Q5E2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
BC005561E9Q5E2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
BC005561E9Q5E2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
BC005561E9Q5E2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
BC005561E9Q5E2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
BC005561E9Q5E2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
BC005561E9Q5E2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
BC005561E9Q5E2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
BC005561E9Q5E2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
BC005561E9Q5E2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
BC005561E9Q5E2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms