Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc71lE9Q4T4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71lE9Q4T4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71lE9Q4T4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71lE9Q4T4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc71lE9Q4T4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc71lE9Q4T4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms