Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4E0

5031410I06Rik, RIKEN cDNA 5031410I06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5031410I06RikE9Q4E0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
5031410I06RikE9Q4E0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
5031410I06RikE9Q4E0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
5031410I06RikE9Q4E0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
5031410I06RikE9Q4E0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
5031410I06RikE9Q4E0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
5031410I06RikE9Q4E0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
5031410I06RikE9Q4E0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
5031410I06RikE9Q4E0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
5031410I06RikE9Q4E0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
5031410I06RikE9Q4E0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
5031410I06RikE9Q4E0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
5031410I06RikE9Q4E0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
5031410I06RikE9Q4E0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
5031410I06RikE9Q4E0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
5031410I06RikE9Q4E0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
5031410I06RikE9Q4E0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
5031410I06RikE9Q4E0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
5031410I06RikE9Q4E0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
5031410I06RikE9Q4E0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
5031410I06RikE9Q4E0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
5031410I06RikE9Q4E0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
5031410I06RikE9Q4E0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
5031410I06RikE9Q4E0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
5031410I06RikE9Q4E0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
5031410I06RikE9Q4E0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
5031410I06RikE9Q4E0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
5031410I06RikE9Q4E0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
5031410I06RikE9Q4E0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
5031410I06RikE9Q4E0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
5031410I06RikE9Q4E0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
5031410I06RikE9Q4E0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
5031410I06RikE9Q4E0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
5031410I06RikE9Q4E0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
5031410I06RikE9Q4E0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
5031410I06RikE9Q4E0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
5031410I06RikE9Q4E0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
5031410I06RikE9Q4E0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
5031410I06RikE9Q4E0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
5031410I06RikE9Q4E0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
5031410I06RikE9Q4E0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
5031410I06RikE9Q4E0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
5031410I06RikE9Q4E0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
5031410I06RikE9Q4E0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
5031410I06RikE9Q4E0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
5031410I06RikE9Q4E0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
5031410I06RikE9Q4E0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
5031410I06RikE9Q4E0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
5031410I06RikE9Q4E0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.57■■■□□ 2
5031410I06RikE9Q4E0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.57■■■□□ 2
5031410I06RikE9Q4E0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
5031410I06RikE9Q4E0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
5031410I06RikE9Q4E0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
5031410I06RikE9Q4E0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
5031410I06RikE9Q4E0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.56■■■□□ 2
5031410I06RikE9Q4E0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.56■■■□□ 2
5031410I06RikE9Q4E0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
5031410I06RikE9Q4E0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
5031410I06RikE9Q4E0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
5031410I06RikE9Q4E0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
5031410I06RikE9Q4E0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
5031410I06RikE9Q4E0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
5031410I06RikE9Q4E0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
5031410I06RikE9Q4E0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
5031410I06RikE9Q4E0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms