Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm3893E9Q1I1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm3893E9Q1I1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm3893E9Q1I1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm3893E9Q1I1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm3893E9Q1I1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm3893E9Q1I1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm3893E9Q1I1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm3893E9Q1I1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm3893E9Q1I1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm3893E9Q1I1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm3893E9Q1I1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm3893E9Q1I1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm3893E9Q1I1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm3893E9Q1I1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm3893E9Q1I1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm3893E9Q1I1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm3893E9Q1I1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm3893E9Q1I1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm3893E9Q1I1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm3893E9Q1I1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm3893E9Q1I1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm3893E9Q1I1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm3893E9Q1I1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm3893E9Q1I1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm3893E9Q1I1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm3893E9Q1I1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm3893E9Q1I1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm3893E9Q1I1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm3893E9Q1I1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm3893E9Q1I1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm3893E9Q1I1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm3893E9Q1I1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm3893E9Q1I1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm3893E9Q1I1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm3893E9Q1I1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm3893E9Q1I1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm3893E9Q1I1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm3893E9Q1I1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm3893E9Q1I1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm3893E9Q1I1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm3893E9Q1I1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm3893E9Q1I1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm3893E9Q1I1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm3893E9Q1I1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm3893E9Q1I1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm3893E9Q1I1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm3893E9Q1I1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm3893E9Q1I1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm3893E9Q1I1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm3893E9Q1I1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm3893E9Q1I1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm3893E9Q1I1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm3893E9Q1I1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm3893E9Q1I1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm3893E9Q1I1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm3893E9Q1I1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm3893E9Q1I1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm3893E9Q1I1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm3893E9Q1I1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm3893E9Q1I1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm3893E9Q1I1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm3893E9Q1I1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm3893E9Q1I1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm3893E9Q1I1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm3893E9Q1I1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm3893E9Q1I1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm3893E9Q1I1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm3893E9Q1I1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm3893E9Q1I1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm3893E9Q1I1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm3893E9Q1I1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm3893E9Q1I1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm3893E9Q1I1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm3893E9Q1I1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm3893E9Q1I1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm3893E9Q1I1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm3893E9Q1I1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm3893E9Q1I1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm3893E9Q1I1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm3893E9Q1I1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm3893E9Q1I1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm3893E9Q1I1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm3893E9Q1I1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm3893E9Q1I1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm3893E9Q1I1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm3893E9Q1I1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm3893E9Q1I1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm3893E9Q1I1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm3893E9Q1I1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm3893E9Q1I1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm3893E9Q1I1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm3893E9Q1I1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm3893E9Q1I1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm3893E9Q1I1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm3893E9Q1I1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
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