Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt78E9Q0F0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt78E9Q0F0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt78E9Q0F0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt78E9Q0F0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt78E9Q0F0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt78E9Q0F0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt78E9Q0F0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt78E9Q0F0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt78E9Q0F0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt78E9Q0F0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt78E9Q0F0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt78E9Q0F0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt78E9Q0F0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt78E9Q0F0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt78E9Q0F0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Krt78E9Q0F0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt78E9Q0F0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt78E9Q0F0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt78E9Q0F0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt78E9Q0F0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt78E9Q0F0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt78E9Q0F0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt78E9Q0F0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt78E9Q0F0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt78E9Q0F0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt78E9Q0F0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt78E9Q0F0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt78E9Q0F0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt78E9Q0F0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt78E9Q0F0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt78E9Q0F0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt78E9Q0F0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt78E9Q0F0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt78E9Q0F0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt78E9Q0F0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt78E9Q0F0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt78E9Q0F0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt78E9Q0F0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt78E9Q0F0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt78E9Q0F0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt78E9Q0F0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt78E9Q0F0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt78E9Q0F0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt78E9Q0F0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt78E9Q0F0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt78E9Q0F0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt78E9Q0F0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt78E9Q0F0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms