Protein–RNA interactions for Protein: E9Q007

Gm4450, Predicted gene 4450, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4450E9Q007 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm4450E9Q007 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm4450E9Q007 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm4450E9Q007 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm4450E9Q007 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm4450E9Q007 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm4450E9Q007 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm4450E9Q007 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm4450E9Q007 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm4450E9Q007 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms