Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brd1E9PZ26 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brd1E9PZ26 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brd1E9PZ26 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brd1E9PZ26 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brd1E9PZ26 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brd1E9PZ26 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Brd1E9PZ26 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Brd1E9PZ26 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Brd1E9PZ26 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Brd1E9PZ26 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Brd1E9PZ26 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Brd1E9PZ26 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Brd1E9PZ26 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Brd1E9PZ26 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Brd1E9PZ26 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Brd1E9PZ26 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Brd1E9PZ26 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Brd1E9PZ26 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Brd1E9PZ26 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Brd1E9PZ26 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Brd1E9PZ26 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Brd1E9PZ26 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Brd1E9PZ26 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Brd1E9PZ26 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Brd1E9PZ26 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Brd1E9PZ26 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Brd1E9PZ26 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Brd1E9PZ26 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Brd1E9PZ26 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Brd1E9PZ26 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Brd1E9PZ26 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Brd1E9PZ26 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Brd1E9PZ26 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brd1E9PZ26 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brd1E9PZ26 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Brd1E9PZ26 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brd1E9PZ26 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brd1E9PZ26 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brd1E9PZ26 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brd1E9PZ26 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brd1E9PZ26 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brd1E9PZ26 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Brd1E9PZ26 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brd1E9PZ26 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brd1E9PZ26 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brd1E9PZ26 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brd1E9PZ26 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brd1E9PZ26 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brd1E9PZ26 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brd1E9PZ26 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brd1E9PZ26 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brd1E9PZ26 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brd1E9PZ26 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brd1E9PZ26 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Brd1E9PZ26 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Brd1E9PZ26 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Brd1E9PZ26 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Brd1E9PZ26 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Brd1E9PZ26 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Brd1E9PZ26 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Brd1E9PZ26 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms