Protein–RNA interactions for Protein: E9PY46

Ift140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift140E9PY46 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ift140E9PY46 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ift140E9PY46 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ift140E9PY46 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ift140E9PY46 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ift140E9PY46 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ift140E9PY46 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ift140E9PY46 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ift140E9PY46 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ift140E9PY46 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ift140E9PY46 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ift140E9PY46 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ift140E9PY46 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Ift140E9PY46 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ift140E9PY46 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ift140E9PY46 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Ift140E9PY46 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ift140E9PY46 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ift140E9PY46 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ift140E9PY46 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Ift140E9PY46 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ift140E9PY46 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ift140E9PY46 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ift140E9PY46 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ift140E9PY46 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ift140E9PY46 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ift140E9PY46 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ift140E9PY46 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ift140E9PY46 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ift140E9PY46 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ift140E9PY46 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ift140E9PY46 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ift140E9PY46 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ift140E9PY46 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ift140E9PY46 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ift140E9PY46 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ift140E9PY46 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ift140E9PY46 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ift140E9PY46 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Ift140E9PY46 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ift140E9PY46 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ift140E9PY46 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ift140E9PY46 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ift140E9PY46 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ift140E9PY46 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ift140E9PY46 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ift140E9PY46 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ift140E9PY46 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ift140E9PY46 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ift140E9PY46 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Ift140E9PY46 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ift140E9PY46 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ift140E9PY46 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ift140E9PY46 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ift140E9PY46 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ift140E9PY46 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ift140E9PY46 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Ift140E9PY46 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ift140E9PY46 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ift140E9PY46 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ift140E9PY46 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ift140E9PY46 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ift140E9PY46 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Ift140E9PY46 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Ift140E9PY46 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Ift140E9PY46 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Ift140E9PY46 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Ift140E9PY46 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ift140E9PY46 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Ift140E9PY46 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ift140E9PY46 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ift140E9PY46 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ift140E9PY46 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ift140E9PY46 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ift140E9PY46 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ift140E9PY46 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ift140E9PY46 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ift140E9PY46 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ift140E9PY46 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ift140E9PY46 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Ift140E9PY46 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Ift140E9PY46 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Ift140E9PY46 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
Ift140E9PY46 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Ift140E9PY46 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ift140E9PY46 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ift140E9PY46 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ift140E9PY46 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ift140E9PY46 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ift140E9PY46 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ift140E9PY46 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ift140E9PY46 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ift140E9PY46 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ift140E9PY46 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ift140E9PY46 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ift140E9PY46 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ift140E9PY46 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ift140E9PY46 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ift140E9PY46 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ift140E9PY46 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms