Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3002E9PW72 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3002E9PW72 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3002E9PW72 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3002E9PW72 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3002E9PW72 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3002E9PW72 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3002E9PW72 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3002E9PW72 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3002E9PW72 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3002E9PW72 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3002E9PW72 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3002E9PW72 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3002E9PW72 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3002E9PW72 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3002E9PW72 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3002E9PW72 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3002E9PW72 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3002E9PW72 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3002E9PW72 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3002E9PW72 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3002E9PW72 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms