Protein–RNA interactions for Protein: E9PVJ0

Gm2956, Predicted gene 2956, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2956E9PVJ0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm2956E9PVJ0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm2956E9PVJ0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm2956E9PVJ0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms