Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc62E9PVD1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc62E9PVD1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc62E9PVD1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms