Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC6

4930558K02Rik, RIKEN cDNA 4930558K02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930558K02RikE0CXC6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930558K02RikE0CXC6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930558K02RikE0CXC6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
4930558K02RikE0CXC6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930558K02RikE0CXC6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930558K02RikE0CXC6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930558K02RikE0CXC6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930558K02RikE0CXC6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930558K02RikE0CXC6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930558K02RikE0CXC6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930558K02RikE0CXC6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930558K02RikE0CXC6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930558K02RikE0CXC6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930558K02RikE0CXC6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930558K02RikE0CXC6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930558K02RikE0CXC6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930558K02RikE0CXC6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930558K02RikE0CXC6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930558K02RikE0CXC6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930558K02RikE0CXC6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930558K02RikE0CXC6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
4930558K02RikE0CXC6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930558K02RikE0CXC6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930558K02RikE0CXC6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930558K02RikE0CXC6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms