Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc78D3Z5T1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc78D3Z5T1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc78D3Z5T1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms