Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccnb1ip1D3Z3K2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccnb1ip1D3Z3K2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccnb1ip1D3Z3K2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccnb1ip1D3Z3K2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccnb1ip1D3Z3K2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccnb1ip1D3Z3K2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccnb1ip1D3Z3K2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccnb1ip1D3Z3K2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccnb1ip1D3Z3K2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms