Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim30cD3YVI9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim30cD3YVI9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim30cD3YVI9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms