Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfx8D3YU81 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx8D3YU81 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfx8D3YU81 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx8D3YU81 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms