Protein–RNA interactions for Protein: B7XG49

Fam71a, Family with sequence similarity 71, member A, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71aB7XG49 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam71aB7XG49 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam71aB7XG49 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam71aB7XG49 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam71aB7XG49 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam71aB7XG49 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam71aB7XG49 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam71aB7XG49 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam71aB7XG49 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam71aB7XG49 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam71aB7XG49 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam71aB7XG49 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam71aB7XG49 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam71aB7XG49 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam71aB7XG49 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam71aB7XG49 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam71aB7XG49 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam71aB7XG49 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam71aB7XG49 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam71aB7XG49 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam71aB7XG49 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam71aB7XG49 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam71aB7XG49 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam71aB7XG49 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam71aB7XG49 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam71aB7XG49 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam71aB7XG49 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam71aB7XG49 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam71aB7XG49 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam71aB7XG49 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam71aB7XG49 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam71aB7XG49 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam71aB7XG49 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms