Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pnldc1B2RXZ1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pnldc1B2RXZ1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pnldc1B2RXZ1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms