Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
1700018F24RikB2RW27 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700018F24RikB2RW27 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700018F24RikB2RW27 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms