Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prrt4B2RU40 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Prrt4B2RU40 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Prrt4B2RU40 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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