Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930402K13RikB1AW18 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930402K13RikB1AW18 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930402K13RikB1AW18 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms