Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a6B1AVK5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Col4a6B1AVK5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms