Protein–RNA interactions for Protein: B1AT01

1700084M14Rik, RIKEN cDNA 1700084M14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700084M14RikB1AT01 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700084M14RikB1AT01 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700084M14RikB1AT01 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700084M14RikB1AT01 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700084M14RikB1AT01 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700084M14RikB1AT01 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700084M14RikB1AT01 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
1700084M14RikB1AT01 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700084M14RikB1AT01 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700084M14RikB1AT01 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700084M14RikB1AT01 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700084M14RikB1AT01 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700084M14RikB1AT01 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700084M14RikB1AT01 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700084M14RikB1AT01 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700084M14RikB1AT01 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
1700084M14RikB1AT01 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700084M14RikB1AT01 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700084M14RikB1AT01 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700084M14RikB1AT01 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700084M14RikB1AT01 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700084M14RikB1AT01 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700084M14RikB1AT01 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700084M14RikB1AT01 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
1700084M14RikB1AT01 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms