Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Spocd1B1ASB6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Spocd1B1ASB6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms