Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grik3B1AS29 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Grik3B1AS29 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grik3B1AS29 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms