Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF0

Skint3, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint3A7TZF0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Skint3A7TZF0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Skint3A7TZF0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Skint3A7TZF0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Skint3A7TZF0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Skint3A7TZF0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Skint3A7TZF0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Skint3A7TZF0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Skint3A7TZF0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Skint3A7TZF0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Skint3A7TZF0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Skint3A7TZF0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Skint3A7TZF0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Skint3A7TZF0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Skint3A7TZF0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Skint3A7TZF0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Skint3A7TZF0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Skint3A7TZF0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Skint3A7TZF0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Skint3A7TZF0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Skint3A7TZF0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Skint3A7TZF0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Skint3A7TZF0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Skint3A7TZF0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Skint3A7TZF0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Skint3A7TZF0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Skint3A7TZF0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Skint3A7TZF0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Skint3A7TZF0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Skint3A7TZF0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Skint3A7TZF0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Skint3A7TZF0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Skint3A7TZF0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Skint3A7TZF0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Skint3A7TZF0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skint3A7TZF0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Skint3A7TZF0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skint3A7TZF0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skint3A7TZF0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Skint3A7TZF0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Skint3A7TZF0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Skint3A7TZF0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Skint3A7TZF0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Skint3A7TZF0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Skint3A7TZF0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skint3A7TZF0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skint3A7TZF0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skint3A7TZF0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skint3A7TZF0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skint3A7TZF0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skint3A7TZF0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skint3A7TZF0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skint3A7TZF0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skint3A7TZF0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skint3A7TZF0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Skint3A7TZF0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skint3A7TZF0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skint3A7TZF0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Skint3A7TZF0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Skint3A7TZF0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Skint3A7TZF0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Skint3A7TZF0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Skint3A7TZF0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Skint3A7TZF0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Skint3A7TZF0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Skint3A7TZF0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Skint3A7TZF0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Skint3A7TZF0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms