Protein–RNA interactions for Protein: A6BLY7

Krt28, Keratin, type I cytoskeletal 28, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt28A6BLY7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt28A6BLY7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt28A6BLY7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt28A6BLY7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt28A6BLY7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt28A6BLY7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt28A6BLY7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt28A6BLY7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Krt28A6BLY7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt28A6BLY7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Krt28A6BLY7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt28A6BLY7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt28A6BLY7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt28A6BLY7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt28A6BLY7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt28A6BLY7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt28A6BLY7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt28A6BLY7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt28A6BLY7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt28A6BLY7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt28A6BLY7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt28A6BLY7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt28A6BLY7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt28A6BLY7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt28A6BLY7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms