Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbp4A4UUI3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbp4A4UUI3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp4A4UUI3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp4A4UUI3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp4A4UUI3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp4A4UUI3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp4A4UUI3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp4A4UUI3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp4A4UUI3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp4A4UUI3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp4A4UUI3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp4A4UUI3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp4A4UUI3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp4A4UUI3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp4A4UUI3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp4A4UUI3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp4A4UUI3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp4A4UUI3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp4A4UUI3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp4A4UUI3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp4A4UUI3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp4A4UUI3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp4A4UUI3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp4A4UUI3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp4A4UUI3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp4A4UUI3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp4A4UUI3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp4A4UUI3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp4A4UUI3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gbp4A4UUI3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gbp4A4UUI3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp4A4UUI3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms