Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Atp8b5A3FIN4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp8b5A3FIN4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp8b5A3FIN4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp8b5A3FIN4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp8b5A3FIN4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp8b5A3FIN4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp8b5A3FIN4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp8b5A3FIN4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp8b5A3FIN4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp8b5A3FIN4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp8b5A3FIN4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp8b5A3FIN4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp8b5A3FIN4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp8b5A3FIN4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp8b5A3FIN4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp8b5A3FIN4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp8b5A3FIN4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp8b5A3FIN4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp8b5A3FIN4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp8b5A3FIN4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp8b5A3FIN4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp8b5A3FIN4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp8b5A3FIN4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp8b5A3FIN4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp8b5A3FIN4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp8b5A3FIN4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp8b5A3FIN4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp8b5A3FIN4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp8b5A3FIN4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp8b5A3FIN4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp8b5A3FIN4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp8b5A3FIN4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp8b5A3FIN4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp8b5A3FIN4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp8b5A3FIN4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp8b5A3FIN4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp8b5A3FIN4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp8b5A3FIN4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp8b5A3FIN4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp8b5A3FIN4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp8b5A3FIN4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp8b5A3FIN4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp8b5A3FIN4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp8b5A3FIN4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp8b5A3FIN4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp8b5A3FIN4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp8b5A3FIN4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp8b5A3FIN4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp8b5A3FIN4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp8b5A3FIN4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp8b5A3FIN4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp8b5A3FIN4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp8b5A3FIN4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp8b5A3FIN4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp8b5A3FIN4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp8b5A3FIN4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp8b5A3FIN4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp8b5A3FIN4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp8b5A3FIN4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp8b5A3FIN4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms