Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ism1A2ATD1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ism1A2ATD1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ism1A2ATD1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms