Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AgrnA2ASQ1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AgrnA2ASQ1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AgrnA2ASQ1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AgrnA2ASQ1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AgrnA2ASQ1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AgrnA2ASQ1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AgrnA2ASQ1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AgrnA2ASQ1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AgrnA2ASQ1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AgrnA2ASQ1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AgrnA2ASQ1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AgrnA2ASQ1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AgrnA2ASQ1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AgrnA2ASQ1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
AgrnA2ASQ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AgrnA2ASQ1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AgrnA2ASQ1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AgrnA2ASQ1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AgrnA2ASQ1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AgrnA2ASQ1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AgrnA2ASQ1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AgrnA2ASQ1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AgrnA2ASQ1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AgrnA2ASQ1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms