Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rtf1A2AQ19 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rtf1A2AQ19 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rtf1A2AQ19 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rtf1A2AQ19 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rtf1A2AQ19 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rtf1A2AQ19 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rtf1A2AQ19 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rtf1A2AQ19 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rtf1A2AQ19 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rtf1A2AQ19 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rtf1A2AQ19 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rtf1A2AQ19 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Rtf1A2AQ19 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rtf1A2AQ19 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Rtf1A2AQ19 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rtf1A2AQ19 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rtf1A2AQ19 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rtf1A2AQ19 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rtf1A2AQ19 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rtf1A2AQ19 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rtf1A2AQ19 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rtf1A2AQ19 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rtf1A2AQ19 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rtf1A2AQ19 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Rtf1A2AQ19 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rtf1A2AQ19 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rtf1A2AQ19 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rtf1A2AQ19 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rtf1A2AQ19 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rtf1A2AQ19 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rtf1A2AQ19 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rtf1A2AQ19 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
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Rtf1A2AQ19 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rtf1A2AQ19 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rtf1A2AQ19 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rtf1A2AQ19 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rtf1A2AQ19 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rtf1A2AQ19 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rtf1A2AQ19 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rtf1A2AQ19 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rtf1A2AQ19 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rtf1A2AQ19 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rtf1A2AQ19 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rtf1A2AQ19 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rtf1A2AQ19 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rtf1A2AQ19 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Rtf1A2AQ19 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rtf1A2AQ19 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rtf1A2AQ19 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rtf1A2AQ19 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rtf1A2AQ19 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rtf1A2AQ19 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rtf1A2AQ19 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rtf1A2AQ19 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Rtf1A2AQ19 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Rtf1A2AQ19 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rtf1A2AQ19 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rtf1A2AQ19 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rtf1A2AQ19 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rtf1A2AQ19 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rtf1A2AQ19 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rtf1A2AQ19 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rtf1A2AQ19 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rtf1A2AQ19 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
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