Protein–RNA interactions for Protein: A2ALU4

Shroom2, Protein Shroom2, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom2A2ALU4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Shroom2A2ALU4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Shroom2A2ALU4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
Shroom2A2ALU4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,31■■■■□ 3,24
Shroom2A2ALU4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
Shroom2A2ALU4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
Shroom2A2ALU4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
Shroom2A2ALU4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
Shroom2A2ALU4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
Shroom2A2ALU4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Shroom2A2ALU4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC35,3■■■■□ 3,24
Shroom2A2ALU4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Shroom2A2ALU4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
Shroom2A2ALU4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
Shroom2A2ALU4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC35,29■■■■□ 3,24
Shroom2A2ALU4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Shroom2A2ALU4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Shroom2A2ALU4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC35,28■■■■□ 3,24
Shroom2A2ALU4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,27■■■■□ 3,24
Shroom2A2ALU4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC35,27■■■■□ 3,24
Shroom2A2ALU4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC35,27■■■■□ 3,24
Shroom2A2ALU4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC35,26■■■■□ 3,23
Shroom2A2ALU4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,25■■■■□ 3,23
Shroom2A2ALU4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC35,25■■■■□ 3,23
Shroom2A2ALU4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC35,25■■■■□ 3,23
Shroom2A2ALU4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC35,24■■■■□ 3,23
Shroom2A2ALU4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,24■■■■□ 3,23
Shroom2A2ALU4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC35,23■■■■□ 3,23
Shroom2A2ALU4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,23■■■■□ 3,23
Shroom2A2ALU4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,23■■■■□ 3,23
Shroom2A2ALU4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35,22■■■■□ 3,23
Shroom2A2ALU4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,22■■■■□ 3,23
Shroom2A2ALU4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,21■■■■□ 3,23
Shroom2A2ALU4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,21■■■■□ 3,23
Shroom2A2ALU4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,21■■■■□ 3,23
Shroom2A2ALU4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
Shroom2A2ALU4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
Shroom2A2ALU4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,19■■■■□ 3,22
Shroom2A2ALU4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Shroom2A2ALU4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Shroom2A2ALU4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Shroom2A2ALU4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,18■■■■□ 3,22
Shroom2A2ALU4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC35,18■■■■□ 3,22
Shroom2A2ALU4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Shroom2A2ALU4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC35,17■■■■□ 3,22
Shroom2A2ALU4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC35,17■■■■□ 3,22
Shroom2A2ALU4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC35,17■■■■□ 3,22
Shroom2A2ALU4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Shroom2A2ALU4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Shroom2A2ALU4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC35,16■■■■□ 3,22
Shroom2A2ALU4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Shroom2A2ALU4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC35,16■■■■□ 3,22
Shroom2A2ALU4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Shroom2A2ALU4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Shroom2A2ALU4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Shroom2A2ALU4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35,16■■■■□ 3,22
Shroom2A2ALU4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
Shroom2A2ALU4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Shroom2A2ALU4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC35,14■■■■□ 3,22
Shroom2A2ALU4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC35,14■■■■□ 3,22
Shroom2A2ALU4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,14■■■■□ 3,22
Shroom2A2ALU4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,22
Shroom2A2ALU4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,22
Shroom2A2ALU4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Shroom2A2ALU4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC35,13■■■■□ 3,21
Shroom2A2ALU4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC35,13■■■■□ 3,21
Shroom2A2ALU4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Shroom2A2ALU4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC35,12■■■■□ 3,21
Shroom2A2ALU4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Shroom2A2ALU4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Shroom2A2ALU4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Shroom2A2ALU4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Shroom2A2ALU4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Shroom2A2ALU4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,1■■■■□ 3,21
Shroom2A2ALU4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
Shroom2A2ALU4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
Shroom2A2ALU4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Shroom2A2ALU4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Shroom2A2ALU4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC35,09■■■■□ 3,21
Shroom2A2ALU4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,09■■■■□ 3,21
Shroom2A2ALU4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,09■■■■□ 3,21
Shroom2A2ALU4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Shroom2A2ALU4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Shroom2A2ALU4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Shroom2A2ALU4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35,08■■■■□ 3,21
Shroom2A2ALU4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Shroom2A2ALU4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,21
Shroom2A2ALU4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,2
Shroom2A2ALU4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC35,07■■■■□ 3,2
Shroom2A2ALU4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Shroom2A2ALU4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC35,06■■■■□ 3,2
Shroom2A2ALU4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC35,05■■■■□ 3,2
Shroom2A2ALU4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Shroom2A2ALU4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Shroom2A2ALU4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Shroom2A2ALU4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Shroom2A2ALU4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Shroom2A2ALU4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Shroom2A2ALU4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC35,04■■■■□ 3,2
Shroom2A2ALU4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC35,04■■■■□ 3,2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38,8 ms