Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Frmpd1A2AKB4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Frmpd1A2AKB4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Frmpd1A2AKB4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Frmpd1A2AKB4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Frmpd1A2AKB4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Frmpd1A2AKB4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
Frmpd1A2AKB4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Frmpd1A2AKB4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
Frmpd1A2AKB4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Frmpd1A2AKB4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
Frmpd1A2AKB4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Frmpd1A2AKB4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Frmpd1A2AKB4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Frmpd1A2AKB4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Frmpd1A2AKB4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Frmpd1A2AKB4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Frmpd1A2AKB4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Frmpd1A2AKB4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
Frmpd1A2AKB4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Frmpd1A2AKB4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Frmpd1A2AKB4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Frmpd1A2AKB4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Frmpd1A2AKB4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Frmpd1A2AKB4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Frmpd1A2AKB4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Frmpd1A2AKB4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Frmpd1A2AKB4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Frmpd1A2AKB4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Frmpd1A2AKB4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Frmpd1A2AKB4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Frmpd1A2AKB4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
Frmpd1A2AKB4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Frmpd1A2AKB4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Frmpd1A2AKB4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Frmpd1A2AKB4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Frmpd1A2AKB4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Frmpd1A2AKB4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Frmpd1A2AKB4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Frmpd1A2AKB4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Frmpd1A2AKB4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Frmpd1A2AKB4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Frmpd1A2AKB4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Frmpd1A2AKB4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Frmpd1A2AKB4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Frmpd1A2AKB4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Frmpd1A2AKB4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Frmpd1A2AKB4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Frmpd1A2AKB4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Frmpd1A2AKB4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Frmpd1A2AKB4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Frmpd1A2AKB4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Frmpd1A2AKB4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Frmpd1A2AKB4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Frmpd1A2AKB4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Frmpd1A2AKB4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Frmpd1A2AKB4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Frmpd1A2AKB4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Frmpd1A2AKB4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Frmpd1A2AKB4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Frmpd1A2AKB4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Frmpd1A2AKB4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Frmpd1A2AKB4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Frmpd1A2AKB4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Frmpd1A2AKB4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Frmpd1A2AKB4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Frmpd1A2AKB4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Frmpd1A2AKB4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Frmpd1A2AKB4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Frmpd1A2AKB4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Frmpd1A2AKB4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Frmpd1A2AKB4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Frmpd1A2AKB4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Frmpd1A2AKB4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Frmpd1A2AKB4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
Frmpd1A2AKB4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Frmpd1A2AKB4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Frmpd1A2AKB4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Frmpd1A2AKB4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Frmpd1A2AKB4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Frmpd1A2AKB4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Frmpd1A2AKB4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Frmpd1A2AKB4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Frmpd1A2AKB4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Frmpd1A2AKB4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Frmpd1A2AKB4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Frmpd1A2AKB4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Frmpd1A2AKB4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Frmpd1A2AKB4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Frmpd1A2AKB4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Frmpd1A2AKB4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Frmpd1A2AKB4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Frmpd1A2AKB4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Frmpd1A2AKB4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Frmpd1A2AKB4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Frmpd1A2AKB4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Frmpd1A2AKB4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Frmpd1A2AKB4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Frmpd1A2AKB4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Frmpd1A2AKB4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.1 ms