Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lcn6A2AJB9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lcn6A2AJB9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lcn6A2AJB9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lcn6A2AJB9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lcn6A2AJB9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lcn6A2AJB9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lcn6A2AJB9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lcn6A2AJB9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lcn6A2AJB9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lcn6A2AJB9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lcn6A2AJB9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lcn6A2AJB9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lcn6A2AJB9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lcn6A2AJB9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lcn6A2AJB9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lcn6A2AJB9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lcn6A2AJB9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lcn6A2AJB9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lcn6A2AJB9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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