Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprfA2A8L5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprfA2A8L5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms