Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chd5A2A8L1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chd5A2A8L1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chd5A2A8L1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chd5A2A8L1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chd5A2A8L1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chd5A2A8L1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chd5A2A8L1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chd5A2A8L1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chd5A2A8L1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chd5A2A8L1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd5A2A8L1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd5A2A8L1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd5A2A8L1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd5A2A8L1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd5A2A8L1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd5A2A8L1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd5A2A8L1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chd5A2A8L1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chd5A2A8L1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd5A2A8L1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd5A2A8L1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd5A2A8L1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chd5A2A8L1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chd5A2A8L1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chd5A2A8L1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Chd5A2A8L1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd5A2A8L1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd5A2A8L1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd5A2A8L1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd5A2A8L1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chd5A2A8L1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chd5A2A8L1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chd5A2A8L1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chd5A2A8L1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chd5A2A8L1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chd5A2A8L1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chd5A2A8L1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Chd5A2A8L1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Chd5A2A8L1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Chd5A2A8L1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chd5A2A8L1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chd5A2A8L1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chd5A2A8L1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chd5A2A8L1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chd5A2A8L1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chd5A2A8L1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chd5A2A8L1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chd5A2A8L1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chd5A2A8L1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chd5A2A8L1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chd5A2A8L1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd5A2A8L1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd5A2A8L1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd5A2A8L1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd5A2A8L1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd5A2A8L1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chd5A2A8L1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chd5A2A8L1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Chd5A2A8L1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chd5A2A8L1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chd5A2A8L1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Chd5A2A8L1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd5A2A8L1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd5A2A8L1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd5A2A8L1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms